Table 1

Distribution of hits of queries in human, chimpanzee, mouse, rat and platypus

human

chimp

mouse

rat

platypus


Query1

79a

84a

62a

42a

28a

13b

1c

18b

0c

10b

1c

12b

0c

3b

0c

0d

22e

0d

16e

0d

15e

0d

5e

0d

2e

42f

1g

50f

0g

37f

0g

25f

0g

23f 0g


Query2

90a

83a

69a

68a

103a

21b

1c

15b

0c

24b

0c

10b

0c

9b

0c

0d

26e

0d

19e

0d

12e

2d

7e

1d

17e

40f

2g

49f

0g

32f

1g

49f

0g

76f

0g


Query3

56a

60a

111a

119a

125a

11b

2c

8b

0c

23b

0c

10b

0c

1b

0c

0d

12e

0d

8e

0d

13e

1d

14e

0d

16e

31f

0g

44f

0g

75f

0g

94f

0g

108f

0g


Query4

17a

14a

10a

14a

12a

3b

0c

1b

0c

3b

0c

3b

0c

0b

0c

0d

5e

1d

4e

0d

3e

0d

2e

0d

2e

9f

0g

8f

0g

4f

0g

9f

0g

10f

0g


Query5

13a

16a

27a

14a

43a

4b

0c

3b

0c

2b

0c

0b

0c

5b

0c

0d

3e

0d

3e

0d

6e

0d

1e

0d

0e

6f

0g

10f

0g

19f

0g

13f

0g

38f

0g


Query6

15a

17a

10a

14a

0a

1b

0c

0b

0c

1b

0c

1b

0c

0d

2e

0d

0e

0d

2e

0d

0e

12f

0g

17f

0g

7f

0g

13f

0g


Query6

69a

79a

99a

274a

23a

a

12b

0c

10b

0c

20b

2c

18b

0c

0b

0c

0d

24e

0d

19e

0d

17e

0d

28e

0d

3e

32f

1g

50f

0g

59f

1g

126f

0g

20f

0g


Query6

76a

102a

81a

90a

45a

b

15b

1c

12b

0c

27b

1c

17b

0c

5b

0c

0d

17e

0f

16e

0d

7e

1d

7e

1d

1e

42f

1g

74f

0g

45f

1g

65f

0g

38f

0g


a: the total number of hits, b: the number of hits in introns, c: the number of hits in novel transcripts or known ncRNAs, d: the number of hits in exons of protein coding genes, e: the number of hits antisense to a gene, f: the number of intergenic hits, g: the number of hits in the 3'UTR or 5'UTR of genes.

He et al. BMC Evolutionary Biology 2011 11:102   doi:10.1186/1471-2148-11-102

Open Data